Neji Hyuga est souvent considéré comme subordonné. Le père de Neji, Hizashi Hyuga, est né en tant que frère cadet de son jumeau, Hiarshi Hyuga. Parce qu’il est né en deuxième position, Hizashi a été placé dans la maison de la branche du clan Hyuga, ce qui a fait naître des années plus tard dans la même faction. À un jeune âge, Neji était marqué avec le sceau de la famille Hyuga Branch afin que la maison principale puisse le punir pour insubordination et protéger le secret du Byakugan s’il mourrait. Hizashi, croyant que Neji se verra refuser son plein potentiel en tant que membre de la maison de branche, a commencé à ressentir ouvertement la maison principale et a été puni à certaines occasions à cause de cela. Dans un cas, la marque de malédiction de Hizashi a été activée pendant que Neji regardait.
En raison des punitions que son père a reçues ainsi que de l'influence de son père, Neji est également venu à la maison principale. Avec le temps, Hizashi se sacrifierait pour sauver la vie de son frère, Hiashi. Neji croyait que Hizashi avait été contraint de renoncer à sa vie parce que la vie de Hiarshi en tant que membre de la maison principale était considérée comme plus précieuse. Neji a blâmé la maison principale pour cette tragédie pour les années à venir, et sa croyance ne serait corrigée qu'après sa défaite par Naruto Uzumaki lors des examens finaux. À ce stade, Neji apprend que son père a volontiers abandonné sa vie pour ne pas sauver un membre de la maison principale, mais pour sauver la vie de son frère et prendre une décision sur son propre destin. En apprenant, ce Neji rejette sa croyance au destin et fait ce qu'il peut pour rectifier ses erreurs. De plus, Neji commence à essayer de remédier aux relations éloignées entre lui et les principaux membres de la Chambre, plus particulièrement en étant plus gentil avec Hinata. Ses efforts semblent efficaces, car il commence à s'entraîner avec Hiashi et, dans la partie II, commence même à porter des robes traditionnelles Hyuga. En tant qu'un autre résultat de sa perte contre Naruto, Neji ne considère plus les gens comme des échecs qui ne peuvent jamais changer, car il suggère qu'il n'aurait pas persévéré dans la situation de Lee, et croit que si Lee travaille assez dur, il peut dépasser le doué. Neji considère également Naruto l'adversaire le plus fort qu'il ait jamais combattu et est reconnaissant que Naruto ait pu l'influencer pour changer.
